一般而言，許多健康資料庫的收集並非以研究為原始目的，因此通常無法直接進行分析，研究者必須了解資料原始收集目的，並先進行繁瑣的資料重整工作，才能進行資料統計分析，回答研究問題。本課程首先介紹國內外大型健康資料庫，以及運用次級健康資料從事研究常用之研究方法與概念；其後，介紹資料處理以及次級資料常用統計分析方法應用實務。進入實務課程後，每堂課有一個主題，教師於課堂講授後，同學當場於課堂上演練習題，並繳交課後作業。在此期間，學生依研究興趣，閱讀文獻、研擬研究計畫書，於課堂上討論計畫大綱，並於期末進行研究成果報告。資料分析實務課程所使用的範本資料庫，以全民健康保險研究資料庫之教學研究用加值資料檔為主。